Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms