Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms