Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBG9

Rnf170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, mousemouse

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf170Q8CBG9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf170Q8CBG9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf170Q8CBG9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf170Q8CBG9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf170Q8CBG9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf170Q8CBG9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf170Q8CBG9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf170Q8CBG9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf170Q8CBG9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf170Q8CBG9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rnf170Q8CBG9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf170Q8CBG9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf170Q8CBG9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rnf170Q8CBG9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf170Q8CBG9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf170Q8CBG9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf170Q8CBG9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rnf170Q8CBG9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rnf170Q8CBG9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf170Q8CBG9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf170Q8CBG9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf170Q8CBG9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf170Q8CBG9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf170Q8CBG9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf170Q8CBG9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Rnf170Q8CBG9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf170Q8CBG9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf170Q8CBG9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rnf170Q8CBG9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rnf170Q8CBG9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rnf170Q8CBG9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rnf170Q8CBG9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Rnf170Q8CBG9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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