Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssuh2Q8C3L1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms