Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3D3

Gm5468, Predicted gene 5468, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5468Q8C3D3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm5468Q8C3D3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5468Q8C3D3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms