Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FarsaQ8C0C7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FarsaQ8C0C7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms