Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rdh12Q8BYK4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh12Q8BYK4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh12Q8BYK4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh12Q8BYK4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh12Q8BYK4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh12Q8BYK4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh12Q8BYK4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh12Q8BYK4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh12Q8BYK4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh12Q8BYK4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh12Q8BYK4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh12Q8BYK4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh12Q8BYK4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh12Q8BYK4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh12Q8BYK4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh12Q8BYK4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh12Q8BYK4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh12Q8BYK4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdh12Q8BYK4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms