Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXZ0

Ctxn3, Cortexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn3Q8BXZ0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctxn3Q8BXZ0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctxn3Q8BXZ0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctxn3Q8BXZ0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctxn3Q8BXZ0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctxn3Q8BXZ0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctxn3Q8BXZ0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctxn3Q8BXZ0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctxn3Q8BXZ0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctxn3Q8BXZ0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctxn3Q8BXZ0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctxn3Q8BXZ0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctxn3Q8BXZ0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctxn3Q8BXZ0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctxn3Q8BXZ0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctxn3Q8BXZ0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctxn3Q8BXZ0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctxn3Q8BXZ0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctxn3Q8BXZ0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctxn3Q8BXZ0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctxn3Q8BXZ0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctxn3Q8BXZ0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctxn3Q8BXZ0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctxn3Q8BXZ0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms