Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms