Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Iffo1Q8BXL9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Iffo1Q8BXL9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Iffo1Q8BXL9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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