Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube3dQ8BX13 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube3dQ8BX13 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube3dQ8BX13 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube3dQ8BX13 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube3dQ8BX13 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube3dQ8BX13 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube3dQ8BX13 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube3dQ8BX13 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube3dQ8BX13 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ube3dQ8BX13 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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