Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ctdsp2Q8BX07 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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