Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWW4

Larp4, La-related protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 719 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp4Q8BWW4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Larp4Q8BWW4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Larp4Q8BWW4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms