Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ckap4Q8BMK4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap4Q8BMK4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap4Q8BMK4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap4Q8BMK4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap4Q8BMK4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap4Q8BMK4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap4Q8BMK4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap4Q8BMK4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap4Q8BMK4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ckap4Q8BMK4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap4Q8BMK4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap4Q8BMK4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap4Q8BMK4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap4Q8BMK4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap4Q8BMK4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ckap4Q8BMK4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms