Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf18Q8BM39 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf18Q8BM39 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf18Q8BM39 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf18Q8BM39 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf18Q8BM39 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf18Q8BM39 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf18Q8BM39 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prpf18Q8BM39 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf18Q8BM39 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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