Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp54Q8BL06 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms