Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpc2Q8BKV1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpc2Q8BKV1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms