Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcal1Q8BJL0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms