Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ73

Rspo4, R-spondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo4Q8BJ73 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms