Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy1Q8BIJ7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms