Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH27

Megf9, Multiple epidermal growth factor-like domains protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Megf9Q8BH27 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Megf9Q8BH27 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Megf9Q8BH27 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms