Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGN8

Synpr, Synaptoporin, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynprQ8BGN8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynprQ8BGN8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms