Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms