Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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