Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-M10.5Q85ZW7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-M10.5Q85ZW7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms