Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChfrQ810L3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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