Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cldn34b3Q80ZS5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cldn34b3Q80ZS5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cldn34b3Q80ZS5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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