Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Amigo1Q80ZD8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms