Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcsk9Q80W65 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcsk9Q80W65 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcsk9Q80W65 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcsk9Q80W65 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcsk9Q80W65 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pcsk9Q80W65 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcsk9Q80W65 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcsk9Q80W65 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcsk9Q80W65 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcsk9Q80W65 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcsk9Q80W65 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcsk9Q80W65 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcsk9Q80W65 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcsk9Q80W65 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcsk9Q80W65 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcsk9Q80W65 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcsk9Q80W65 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcsk9Q80W65 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcsk9Q80W65 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pcsk9Q80W65 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcsk9Q80W65 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcsk9Q80W65 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcsk9Q80W65 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
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Pcsk9Q80W65 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcsk9Q80W65 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcsk9Q80W65 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcsk9Q80W65 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcsk9Q80W65 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pcsk9Q80W65 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Pcsk9Q80W65 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Pcsk9Q80W65 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Pcsk9Q80W65 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Pcsk9Q80W65 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Pcsk9Q80W65 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Pcsk9Q80W65 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Pcsk9Q80W65 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
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Pcsk9Q80W65 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcsk9Q80W65 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Pcsk9Q80W65 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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