Protein–RNA interactions for Protein: Q80W40

Acsm4, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsm4Q80W40 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Acsm4Q80W40 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Acsm4Q80W40 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms