Protein–RNA interactions for Protein: Q80W22

Thnsl2, Threonine synthase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thnsl2Q80W22 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thnsl2Q80W22 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thnsl2Q80W22 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thnsl2Q80W22 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thnsl2Q80W22 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thnsl2Q80W22 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thnsl2Q80W22 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thnsl2Q80W22 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thnsl2Q80W22 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thnsl2Q80W22 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thnsl2Q80W22 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thnsl2Q80W22 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thnsl2Q80W22 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Thnsl2Q80W22 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thnsl2Q80W22 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Thnsl2Q80W22 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thnsl2Q80W22 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Thnsl2Q80W22 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thnsl2Q80W22 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thnsl2Q80W22 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thnsl2Q80W22 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thnsl2Q80W22 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thnsl2Q80W22 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Thnsl2Q80W22 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Thnsl2Q80W22 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thnsl2Q80W22 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms