Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Avl9Q80U56 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms