Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

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Length 2,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Arhgef17Q80U35 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Arhgef17Q80U35 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Arhgef17Q80U35 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Arhgef17Q80U35 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Arhgef17Q80U35 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Arhgef17Q80U35 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Arhgef17Q80U35 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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