Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pja2Q80U04 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pja2Q80U04 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms