Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NischQ80TM9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
NischQ80TM9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
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