Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ube2q1Q7TSS2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ube2q1Q7TSS2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ube2q1Q7TSS2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ube2q1Q7TSS2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms