Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1cQ7TSF0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms