Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek5Q7TSC3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek5Q7TSC3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek5Q7TSC3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek5Q7TSC3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek5Q7TSC3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek5Q7TSC3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nek5Q7TSC3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek5Q7TSC3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek5Q7TSC3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek5Q7TSC3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek5Q7TSC3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek5Q7TSC3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek5Q7TSC3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek5Q7TSC3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek5Q7TSC3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek5Q7TSC3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek5Q7TSC3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nek5Q7TSC3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nek5Q7TSC3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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