Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shq1Q7TMX5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms