Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ScocQ78YZ6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms