Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Eci3Q78JN3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eci3Q78JN3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms