Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd3eapQ76KJ5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms