Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SynmQ70IV5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms