Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NinlQ6ZQ12 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NinlQ6ZQ12 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
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