Protein–RNA interactions for Protein: Q6W3F0

P4ha3, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha3Q6W3F0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P4ha3Q6W3F0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms