Protein–RNA interactions for Protein: Q6V4S5

Sdk2, Protein sidekick-2, mousemouse

Predictions only

Length 2,176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdk2Q6V4S5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sdk2Q6V4S5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sdk2Q6V4S5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms