Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Bnip1Q6QD59 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Bnip1Q6QD59 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms