Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Med16Q6PGF3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms