Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc85bQ6PDY0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc85bQ6PDY0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms