Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dtx4Q6PDK8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dtx4Q6PDK8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms